Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CtssO70370 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CtssO70370 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CtssO70370 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtssO70370 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtssO70370 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtssO70370 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtssO70370 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms