Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf5O70191 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atf5O70191 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atf5O70191 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms