Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Alx3O70137 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Alx3O70137 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms