Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb5O55234 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms