Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ChkbO55229 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ChkbO55229 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ChkbO55229 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms