Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cbx4O55187 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cbx4O55187 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms