Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp26a1O55127 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp26a1O55127 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms