Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syngr1O55100 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms