Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Copb2O55029 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Copb2O55029 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Copb2O55029 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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