Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc3O55013 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms