Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnajb6O54946 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb6O54946 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb6O54946 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb6O54946 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb6O54946 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnajb6O54946 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnajb6O54946 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms