Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itgb3O54890 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itgb3O54890 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms