Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DffaO54786 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DffaO54786 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DffaO54786 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DffaO54786 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DffaO54786 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DffaO54786 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DffaO54786 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DffaO54786 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
DffaO54786 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DffaO54786 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DffaO54786 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DffaO54786 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DffaO54786 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DffaO54786 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DffaO54786 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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