Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FxnO35943 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FxnO35943 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FxnO35943 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FxnO35943 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FxnO35943 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FxnO35943 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FxnO35943 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FxnO35943 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FxnO35943 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FxnO35943 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FxnO35943 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FxnO35943 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FxnO35943 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FxnO35943 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FxnO35943 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FxnO35943 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FxnO35943 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms