Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pik3cdO35904 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pik3cdO35904 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms