Protein–RNA interactions for Protein: O35885

Ascl2, Achaete-scute homolog 2, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl2O35885 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ascl2O35885 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ascl2O35885 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ascl2O35885 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ascl2O35885 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ascl2O35885 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ascl2O35885 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ascl2O35885 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ascl2O35885 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ascl2O35885 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms