Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnfrsf18O35714 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnfrsf18O35714 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms