Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppfibp2O35711 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppfibp2O35711 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms