Protein–RNA interactions for Protein: O35691

Pnn, Pinin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnnO35691 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PnnO35691 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PnnO35691 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PnnO35691 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PnnO35691 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PnnO35691 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PnnO35691 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PnnO35691 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PnnO35691 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms