Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NudcO35685 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NudcO35685 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NudcO35685 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NudcO35685 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NudcO35685 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NudcO35685 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NudcO35685 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NudcO35685 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NudcO35685 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NudcO35685 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NudcO35685 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NudcO35685 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NudcO35685 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NudcO35685 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NudcO35685 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NudcO35685 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NudcO35685 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NudcO35685 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NudcO35685 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NudcO35685 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NudcO35685 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NudcO35685 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NudcO35685 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NudcO35685 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NudcO35685 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms