Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1dO35473 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C1dO35473 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1dO35473 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1dO35473 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1dO35473 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1dO35473 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1dO35473 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1dO35473 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1dO35473 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C1dO35473 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C1dO35473 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C1dO35473 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C1dO35473 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C1dO35473 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1dO35473 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
C1dO35473 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms