Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TnxbO35452 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TnxbO35452 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TnxbO35452 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms