Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppef2O35385 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppef2O35385 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms