Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dgcr6O35347 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms