Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe40O35185 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms