Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smad6O35182 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smad6O35182 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms