Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Polr1aO35134 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Polr1aO35134 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Polr1aO35134 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms