Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cldn4O35054 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn4O35054 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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