Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casq1O09165 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Casq1O09165 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casq1O09165 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Casq1O09165 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Casq1O09165 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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