Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms