Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CckarO08786 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CckarO08786 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CckarO08786 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckarO08786 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckarO08786 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckarO08786 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms