Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ascl4M0QW46 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms