Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm3424L7N298 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms