Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm20939L7N243 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm20939L7N243 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm20939L7N243 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm20939L7N243 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm20939L7N243 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm20939L7N243 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm20939L7N243 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20939L7N243 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm20939L7N243 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20939L7N243 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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