Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IfnabL7MTU6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IfnabL7MTU6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms