Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccer2J3QPU5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccer2J3QPU5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms