Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm21900J3QP38 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm21900J3QP38 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms