Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10428J3QNV7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10428J3QNV7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms