Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm21788J3QNH3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21788J3QNH3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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