Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm3336J3QMQ6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3336J3QMQ6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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