Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
4930544D05RikJ3QK56 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
4930544D05RikJ3QK56 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms