Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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