Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pot1bH7BX60 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms