Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Taf4bG5E8Z2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Taf4bG5E8Z2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms