Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tubgcp6G5E8P0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms