Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933406M09RikG3XA12 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933406M09RikG3XA12 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms