Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pcf11G3X9Z4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pcf11G3X9Z4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms