Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r58G3X9U3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r58G3X9U3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms