Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Obox6G3X9U1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Obox6G3X9U1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms