Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc9a3G3X939 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc9a3G3X939 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms